花嶼國小位於澎湖縣花嶼，是縣內唯一間三級離島學校，也是島上唯一教育機構，自民國五十七年起就肩負起島上的教育工作，目前全校為4班，附設幼兒園1班，校地為原日據時代駐在所，門牌號碼為花嶼村2號，是島上目前最小的號碼。

每天早上7:30~7:50為全校晨讀時間，全校學生集中到圖書書進行MSSR，並由導護老師陪同，非導護人員亦可加入。並於學期中，讓每一位學生都有機會上台分享所閱讀的故事。