本校位處烈嶼的中心區域，是小金門的首善之區，學校雖然不大，但卻有一段輝煌的歷史。


民國10年2月她誕生了，那時候叫「第六區烈嶼第一國民學校」，經費自籌。
民國40年7月易名為「烈嶼中心國民學校」。
民國47年因中共發動舉世聞名的823砲戰，學校因而停辦。
政府為顧及學生學業，於民國48年8月暫借金中校舍，成立了「烈嶼聯合國民學校」， 招收三年級以上學生，享受公費住校，並在烈嶼各村設立分校招收一、二年級學生。
民國49年8月，因金中復校，校址就遷移到中興崗（現在的開瑄國小現址）。
民國51年，政府為體恤學童長途涉水唸書之苦，就在現在的地址由政府撥款駐軍協助興建校舍，52年2月啟用。當時為紀念韓師長卓環將軍擘劃督導興建之功，特地將學校命名為「卓環中心國民學校」。
民國56年9月政府延長國民義務教育，奉命更名為「金門縣烈嶼鄉卓環國民小學」。
民國63年8月由於學區縮減，學生人數日減，將西口及黃埔兩所國小併入本校，成為本校之分校。
民國65年8月奉命籌辦幼稚教育，旋即成立幼稚班二班。
民國74年8月，黃埔分校更名為黃埔分班；民國76年8月因學生人數銳減奉令停辦，學生併入西口分校及本校就讀。
民國87年8月，西口分校奉命獨立設校。
民國93年8月奉命實施幼稚班全日制，幼兒教育更趨健全。
民國93年8月奉命增設特殊教育資源班一班，負責烈嶼學區各國小及幼稚班特殊學生的巡迴輔導工作。

綜觀「卓環」的沿革實為烈嶼國小教育的一篇坎坷史。但是在這兒長大的每位「卓環人」更能體會出環境的艱辛，不怕風吹、不怕雨打，成長愈趨堅強，終能茁壯、開花、結果。

1.「閱讀起步走」常態性活動
（1）學校共讀活動：每週晨光共讀時間，閱讀學年共讀書目，鼓勵老師製作共讀書目之導讀單或學習單，供學年教學使用。
（2）營造多元閱讀環境：豐富閱讀內涵，辦理各項閱讀活動，激勵閱讀興趣，如：深耕說故事活動──每星期二、五8：00~8：35師生晨光時間，依照低中高年級推動衍禛老師說故事，讓學生遨遊閱讀的天空。
（3）閱讀護照推動活動：請導師協助1-3年級講解圖書館的使用及借閱規則及有獎徵答活動；4-6年級介紹各類圖書館的功能與類型、圖書的分類、書的構造、圖書館的使用及借閱規則、網路搜尋圖書資訊的方法及新書導讀。
（4）推動讀報教育：進行「金門日報」的語文投稿活動，及有獎徵答摸彩活動，每週五名獲得文具小禮物。
(5)舉辦「超級金頭腦」活動，透過趣味性的擂台賽，加深對共讀書目的閱讀，提高閱讀的興趣
(6)選擇優良影片，辦理影展，並結合每月徵文，做影片心得之寫作比賽，請導師協助收取作品並篩選。
(7)辦理學生閱讀創意比賽：舉辦好書分享、故事書改編劇本、故事書改編戲劇展演活動。
(8)主題閱讀活動：按月辦理不同主題的閱讀，擴展閱讀面向，如：主題探索──鳥類大觀園，高年級查鳥類資料比賽；中年級：影片欣賞──迷雁返家路、有獎徵答；低年級：繪本閱讀，進行鳥類繪畫比賽。週會時間：經驗分享──主題書介紹或說相關的故事。
（9）閱讀策略指導：精進閱讀課時，利用「八何法」指導學生如何提問，幫助閱讀理解。
(10)定期辦理閱讀測驗，檢核學童的閱讀能力