雲林縣土庫國民小學於民前13年11月4日初創立，位於土庫三鹹館，稱為「台中縣土庫公學校」；民國39年12月25日行政區重劃校名改為「雲林縣土庫鎮土庫國民學校」；民國 57 年 8 月1日實施九年國民教育校名改為「 雲林縣土庫鎮土庫國民小學」。建校迄今己逾120餘年，為雲林縣少數百年學校之一。
本校校地面積約一.九五七公頃，含資源班共29班，另有附設幼兒園1班，且鄰近鎮圖書館、附設補校三班。
本校學區遼闊，歷史悠久，是土庫鎮中心國小，全校教師平日善盡職責，諄諄教誨，學生天真活潑，朝氣蓬勃一團和氣。校區鄰土庫市鎮，環境幽雅，成為星期假日民眾遊憩中心。
學校在現任關勝周校長的帶領下，不僅逐步完成硬體的整建，更在校務發展上不斷創新與成長，前盼能建立親師生的幸福學園，為學校注入源源不絕的活力，使學校的經營得以永續發展。

由各學年統一每周實施一日晨讀活動，內容包含全校老師帶領的共讀書箱(包含愛的書庫)的導讀、低年級故事媽媽入校說故事、高年級的讀報教育；許多學子也會利用學校圖書室和鎮圖書館的資源，在下課或回家進行閱讀活動，在身教式閱讀推廣上不遺餘力且行之多年。